Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
MKRN3Q13064 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
MKRN3Q13064 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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