Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
BNIP3Q12983 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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BNIP3Q12983 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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BNIP3Q12983 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
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BNIP3Q12983 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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BNIP3Q12983 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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BNIP3Q12983 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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BNIP3Q12983 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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BNIP3Q12983 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
BNIP3Q12983 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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