Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CHRNEQ04844 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHRNEQ04844 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.3 ms