Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
J3KRW8 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
J3KRW8 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
J3KRW8 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
J3KRW8 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
J3KRW8 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
J3KRW8 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
J3KRW8 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
J3KRW8 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
J3KRW8 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
J3KRW8 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
J3KRW8 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
J3KRW8 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
J3KRW8 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
J3KRW8 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
J3KRW8 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
J3KRW8 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
J3KRW8 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
J3KRW8 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
J3KRW8 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
J3KRW8 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
J3KRW8 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
J3KRW8 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
J3KRW8 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
J3KRW8 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
J3KRW8 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
J3KRW8 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
J3KRW8 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
J3KRW8 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
J3KRW8 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
J3KRW8 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
J3KRW8 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
J3KRW8 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
J3KRW8 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
J3KRW8 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
J3KRW8 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
J3KRW8 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
J3KRW8 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
J3KRW8 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
J3KRW8 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
J3KRW8 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
J3KRW8 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
J3KRW8 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
J3KRW8 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
J3KRW8 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
J3KRW8 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
J3KRW8 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
J3KRW8 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
J3KRW8 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
J3KRW8 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
J3KRW8 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
J3KRW8 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
J3KRW8 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
J3KRW8 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
J3KRW8 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
J3KRW8 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
J3KRW8 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
J3KRW8 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
J3KRW8 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
J3KRW8 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
J3KRW8 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
J3KRW8 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
J3KRW8 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
J3KRW8 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
J3KRW8 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
J3KRW8 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
J3KRW8 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
J3KRW8 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
J3KRW8 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
J3KRW8 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
J3KRW8 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
J3KRW8 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
J3KRW8 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
J3KRW8 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
J3KRW8 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
J3KRW8 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
J3KRW8 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
J3KRW8 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
J3KRW8 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
J3KRW8 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
J3KRW8 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
J3KRW8 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
J3KRW8 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
J3KRW8 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
J3KRW8 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
J3KRW8 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
J3KRW8 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
J3KRW8 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
J3KRW8 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
J3KRW8 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
J3KRW8 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
J3KRW8 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
J3KRW8 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
J3KRW8 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
J3KRW8 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
J3KRW8 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
J3KRW8 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
J3KRW8 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
J3KRW8 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
J3KRW8 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.8 ms