Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A3GALT2U3KPV4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A3GALT2U3KPV4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A3GALT2U3KPV4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A3GALT2U3KPV4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A3GALT2U3KPV4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A3GALT2U3KPV4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A3GALT2U3KPV4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A3GALT2U3KPV4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A3GALT2U3KPV4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A3GALT2U3KPV4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A3GALT2U3KPV4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A3GALT2U3KPV4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A3GALT2U3KPV4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A3GALT2U3KPV4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A3GALT2U3KPV4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A3GALT2U3KPV4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A3GALT2U3KPV4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A3GALT2U3KPV4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A3GALT2U3KPV4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A3GALT2U3KPV4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A3GALT2U3KPV4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A3GALT2U3KPV4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A3GALT2U3KPV4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A3GALT2U3KPV4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A3GALT2U3KPV4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A3GALT2U3KPV4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A3GALT2U3KPV4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A3GALT2U3KPV4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A3GALT2U3KPV4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
A3GALT2U3KPV4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A3GALT2U3KPV4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
A3GALT2U3KPV4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A3GALT2U3KPV4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A3GALT2U3KPV4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A3GALT2U3KPV4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A3GALT2U3KPV4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A3GALT2U3KPV4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A3GALT2U3KPV4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A3GALT2U3KPV4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A3GALT2U3KPV4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms