Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP16Q9Y5T5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms