Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC36.24■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC36.22■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
DCAF1Q9Y4B6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms