Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms