Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHORDC1Q9UHD1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms