Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH4

Taf8, Transcription initiation factor TFIID subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf8Q9EQH4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf8Q9EQH4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf8Q9EQH4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf8Q9EQH4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms