Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CARMIL3Q8ND23 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms