Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
XIRP1Q702N8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms