Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms