Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DDX39BQ13838 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DDX39BQ13838 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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