Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN12Q05209 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms