Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPEQ02224 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms