Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MLH1P40692 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MLH1P40692 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MLH1P40692 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MLH1P40692 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MLH1P40692 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MLH1P40692 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MLH1P40692 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MLH1P40692 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MLH1P40692 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MLH1P40692 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MLH1P40692 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MLH1P40692 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MLH1P40692 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MLH1P40692 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MLH1P40692 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MLH1P40692 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MLH1P40692 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MLH1P40692 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MLH1P40692 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MLH1P40692 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MLH1P40692 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MLH1P40692 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MLH1P40692 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MLH1P40692 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MLH1P40692 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MLH1P40692 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MLH1P40692 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MLH1P40692 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MLH1P40692 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MLH1P40692 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MLH1P40692 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MLH1P40692 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MLH1P40692 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MLH1P40692 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MLH1P40692 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MLH1P40692 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MLH1P40692 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MLH1P40692 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MLH1P40692 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MLH1P40692 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MLH1P40692 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MLH1P40692 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MLH1P40692 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MLH1P40692 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MLH1P40692 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MLH1P40692 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MLH1P40692 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MLH1P40692 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MLH1P40692 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MLH1P40692 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MLH1P40692 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MLH1P40692 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MLH1P40692 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MLH1P40692 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MLH1P40692 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MLH1P40692 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MLH1P40692 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MLH1P40692 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MLH1P40692 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MLH1P40692 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MLH1P40692 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MLH1P40692 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MLH1P40692 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MLH1P40692 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MLH1P40692 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MLH1P40692 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MLH1P40692 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MLH1P40692 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MLH1P40692 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MLH1P40692 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MLH1P40692 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MLH1P40692 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MLH1P40692 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MLH1P40692 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MLH1P40692 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MLH1P40692 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MLH1P40692 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MLH1P40692 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MLH1P40692 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MLH1P40692 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MLH1P40692 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MLH1P40692 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MLH1P40692 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MLH1P40692 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MLH1P40692 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MLH1P40692 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MLH1P40692 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MLH1P40692 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MLH1P40692 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MLH1P40692 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MLH1P40692 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MLH1P40692 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MLH1P40692 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MLH1P40692 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MLH1P40692 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MLH1P40692 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MLH1P40692 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MLH1P40692 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MLH1P40692 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms