Protein–RNA interactions for Protein: P40199

CEACAM6, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM6P40199 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms