Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AC087627.1-201ENST00000522339 993 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AC027013.1-201ENST00000554412 1057 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 ID2-AS1-207ENST00000455965 794 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 CKMT2-AS1-206ENST00000511495 585 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AC023194.3-201ENST00000522679 277 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AC109597.1-201ENST00000564016 786 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 ZRANB2-AS1-202ENST00000450461 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 IFNA5-201ENST00000610521 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AL360169.2-201ENST00000619713 561 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AL133216.1-201ENST00000428915 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AC090371.1-201ENST00000580071 558 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 PRL-202ENST00000615510 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 GNG2-216ENST00000615906 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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