Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YY1P25490 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YY1P25490 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YY1P25490 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YY1P25490 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YY1P25490 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YY1P25490 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YY1P25490 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YY1P25490 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YY1P25490 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
YY1P25490 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YY1P25490 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YY1P25490 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
YY1P25490 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YY1P25490 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YY1P25490 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
YY1P25490 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YY1P25490 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YY1P25490 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
YY1P25490 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YY1P25490 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YY1P25490 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
YY1P25490 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YY1P25490 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YY1P25490 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YY1P25490 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
YY1P25490 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
YY1P25490 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YY1P25490 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YY1P25490 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YY1P25490 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
YY1P25490 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YY1P25490 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YY1P25490 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YY1P25490 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YY1P25490 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YY1P25490 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YY1P25490 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YY1P25490 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YY1P25490 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YY1P25490 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YY1P25490 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YY1P25490 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YY1P25490 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YY1P25490 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YY1P25490 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YY1P25490 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YY1P25490 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YY1P25490 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YY1P25490 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YY1P25490 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YY1P25490 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YY1P25490 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YY1P25490 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YY1P25490 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YY1P25490 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YY1P25490 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YY1P25490 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YY1P25490 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YY1P25490 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YY1P25490 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YY1P25490 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YY1P25490 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YY1P25490 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YY1P25490 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YY1P25490 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YY1P25490 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YY1P25490 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YY1P25490 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
YY1P25490 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YY1P25490 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YY1P25490 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YY1P25490 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YY1P25490 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YY1P25490 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YY1P25490 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YY1P25490 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YY1P25490 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YY1P25490 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YY1P25490 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YY1P25490 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YY1P25490 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YY1P25490 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YY1P25490 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YY1P25490 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YY1P25490 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YY1P25490 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YY1P25490 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YY1P25490 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YY1P25490 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YY1P25490 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YY1P25490 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YY1P25490 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YY1P25490 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YY1P25490 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YY1P25490 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YY1P25490 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YY1P25490 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YY1P25490 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YY1P25490 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms