Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1P21675 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1P21675 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1P21675 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1P21675 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1P21675 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1P21675 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1P21675 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1P21675 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1P21675 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1P21675 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1P21675 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1P21675 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1P21675 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1P21675 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1P21675 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1P21675 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1P21675 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1P21675 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1P21675 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1P21675 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1P21675 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1P21675 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1P21675 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TAF1P21675 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
TAF1P21675 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
TAF1P21675 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1P21675 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1P21675 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1P21675 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1P21675 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1P21675 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1P21675 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1P21675 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1P21675 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1P21675 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1P21675 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1P21675 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1P21675 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1P21675 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1P21675 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1P21675 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1P21675 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1P21675 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1P21675 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1P21675 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1P21675 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1P21675 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1P21675 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1P21675 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1P21675 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1P21675 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1P21675 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1P21675 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1P21675 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1P21675 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1P21675 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1P21675 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1P21675 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1P21675 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1P21675 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1P21675 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1P21675 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1P21675 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1P21675 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1P21675 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1P21675 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1P21675 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1P21675 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1P21675 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1P21675 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1P21675 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1P21675 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1P21675 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1P21675 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1P21675 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1P21675 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1P21675 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1P21675 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1P21675 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1P21675 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1P21675 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1P21675 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1P21675 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1P21675 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1P21675 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1P21675 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1P21675 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1P21675 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1P21675 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1P21675 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1P21675 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1P21675 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1P21675 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1P21675 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1P21675 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1P21675 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1P21675 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1P21675 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1P21675 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms