Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NF1P21359 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NF1P21359 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NF1P21359 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NF1P21359 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NF1P21359 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NF1P21359 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NF1P21359 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NF1P21359 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NF1P21359 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NF1P21359 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NF1P21359 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NF1P21359 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NF1P21359 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NF1P21359 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NF1P21359 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NF1P21359 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NF1P21359 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NF1P21359 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NF1P21359 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NF1P21359 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NF1P21359 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NF1P21359 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NF1P21359 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NF1P21359 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NF1P21359 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NF1P21359 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NF1P21359 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NF1P21359 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NF1P21359 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NF1P21359 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NF1P21359 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NF1P21359 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NF1P21359 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NF1P21359 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NF1P21359 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NF1P21359 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NF1P21359 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NF1P21359 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NF1P21359 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NF1P21359 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NF1P21359 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NF1P21359 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NF1P21359 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NF1P21359 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NF1P21359 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NF1P21359 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NF1P21359 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NF1P21359 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NF1P21359 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NF1P21359 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NF1P21359 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NF1P21359 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NF1P21359 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NF1P21359 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NF1P21359 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NF1P21359 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NF1P21359 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NF1P21359 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NF1P21359 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NF1P21359 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NF1P21359 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NF1P21359 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NF1P21359 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NF1P21359 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NF1P21359 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NF1P21359 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NF1P21359 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NF1P21359 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NF1P21359 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NF1P21359 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NF1P21359 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NF1P21359 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NF1P21359 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NF1P21359 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NF1P21359 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NF1P21359 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NF1P21359 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NF1P21359 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NF1P21359 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NF1P21359 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NF1P21359 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NF1P21359 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NF1P21359 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NF1P21359 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NF1P21359 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NF1P21359 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NF1P21359 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NF1P21359 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NF1P21359 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NF1P21359 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NF1P21359 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NF1P21359 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NF1P21359 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NF1P21359 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NF1P21359 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NF1P21359 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NF1P21359 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NF1P21359 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NF1P21359 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms