Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VGFO15240 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
VGFO15240 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VGFO15240 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VGFO15240 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
VGFO15240 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VGFO15240 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
VGFO15240 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VGFO15240 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VGFO15240 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VGFO15240 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VGFO15240 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VGFO15240 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VGFO15240 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
VGFO15240 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VGFO15240 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VGFO15240 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VGFO15240 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VGFO15240 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
VGFO15240 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VGFO15240 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VGFO15240 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VGFO15240 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VGFO15240 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VGFO15240 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VGFO15240 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VGFO15240 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VGFO15240 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VGFO15240 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VGFO15240 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VGFO15240 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VGFO15240 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VGFO15240 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VGFO15240 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VGFO15240 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VGFO15240 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VGFO15240 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VGFO15240 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VGFO15240 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
VGFO15240 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VGFO15240 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VGFO15240 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VGFO15240 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VGFO15240 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VGFO15240 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VGFO15240 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VGFO15240 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VGFO15240 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VGFO15240 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VGFO15240 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VGFO15240 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VGFO15240 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VGFO15240 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VGFO15240 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VGFO15240 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VGFO15240 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VGFO15240 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VGFO15240 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VGFO15240 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VGFO15240 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VGFO15240 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VGFO15240 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VGFO15240 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VGFO15240 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VGFO15240 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VGFO15240 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VGFO15240 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VGFO15240 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VGFO15240 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VGFO15240 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VGFO15240 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VGFO15240 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VGFO15240 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VGFO15240 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VGFO15240 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VGFO15240 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VGFO15240 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
VGFO15240 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
VGFO15240 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VGFO15240 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VGFO15240 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VGFO15240 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
VGFO15240 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VGFO15240 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VGFO15240 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VGFO15240 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VGFO15240 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VGFO15240 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VGFO15240 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VGFO15240 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VGFO15240 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VGFO15240 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VGFO15240 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VGFO15240 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VGFO15240 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VGFO15240 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
VGFO15240 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VGFO15240 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VGFO15240 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VGFO15240 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms