Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Apba1B2RUJ5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms