Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP18Q9UMW8 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP18Q9UMW8 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP18Q9UMW8 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
USP18Q9UMW8 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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USP18Q9UMW8 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3□□□□□ -1.93
USP18Q9UMW8 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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USP18Q9UMW8 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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USP18Q9UMW8 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
USP18Q9UMW8 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
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USP18Q9UMW8 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP18Q9UMW8 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
USP18Q9UMW8 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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USP18Q9UMW8 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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USP18Q9UMW8 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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USP18Q9UMW8 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP18Q9UMW8 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP18Q9UMW8 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP18Q9UMW8 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP18Q9UMW8 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
USP18Q9UMW8 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
USP18Q9UMW8 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
USP18Q9UMW8 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
USP18Q9UMW8 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
USP18Q9UMW8 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
USP18Q9UMW8 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP18Q9UMW8 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP18Q9UMW8 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP18Q9UMW8 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP18Q9UMW8 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP18Q9UMW8 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP18Q9UMW8 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP18Q9UMW8 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
USP18Q9UMW8 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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USP18Q9UMW8 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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USP18Q9UMW8 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
USP18Q9UMW8 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
USP18Q9UMW8 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
USP18Q9UMW8 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
USP18Q9UMW8 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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USP18Q9UMW8 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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USP18Q9UMW8 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
USP18Q9UMW8 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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