Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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TRERF1Q96PN7 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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TRERF1Q96PN7 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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TRERF1Q96PN7 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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TRERF1Q96PN7 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
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TRERF1Q96PN7 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
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TRERF1Q96PN7 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRERF1Q96PN7 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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