Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RNF20Q5VTR2 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RNF20Q5VTR2 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RNF20Q5VTR2 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RNF20Q5VTR2 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RNF20Q5VTR2 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RNF20Q5VTR2 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RNF20Q5VTR2 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
RNF20Q5VTR2 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
RNF20Q5VTR2 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
RNF20Q5VTR2 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
RNF20Q5VTR2 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
RNF20Q5VTR2 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
RNF20Q5VTR2 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RNF20Q5VTR2 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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