Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
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CDO1Q16878 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
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CDO1Q16878 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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CDO1Q16878 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
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CDO1Q16878 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
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CDO1Q16878 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDO1Q16878 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
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