Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPN21Q16825 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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