Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
HIF1AQ16665 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HIF1AQ16665 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms