Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms