Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMCO1Q147U7 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
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SMCO1Q147U7 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
SMCO1Q147U7 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
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