Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
BECN1Q14457 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms