Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
GTF2H2Q13888 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GTF2H2Q13888 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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