Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DNASE1L3Q13609 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms