Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
MKRN4PQ13434 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
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