Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATMQ13315 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATMQ13315 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATMQ13315 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATMQ13315 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATMQ13315 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATMQ13315 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATMQ13315 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATMQ13315 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
ATMQ13315 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ATMQ13315 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ATMQ13315 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ATMQ13315 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ATMQ13315 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ATMQ13315 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ATMQ13315 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ATMQ13315 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.08□□□□□ -2.58
ATMQ13315 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ATMQ13315 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ATMQ13315 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
ATMQ13315 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ATMQ13315 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ATMQ13315 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
ATMQ13315 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ATMQ13315 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATMQ13315 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATMQ13315 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATMQ13315 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATMQ13315 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATMQ13315 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATMQ13315 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATMQ13315 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATMQ13315 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATMQ13315 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATMQ13315 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATMQ13315 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATMQ13315 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ATMQ13315 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATMQ13315 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATMQ13315 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATMQ13315 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATMQ13315 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATMQ13315 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATMQ13315 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATMQ13315 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATMQ13315 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATMQ13315 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATMQ13315 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATMQ13315 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATMQ13315 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATMQ13315 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ATMQ13315 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ATMQ13315 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ATMQ13315 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ATMQ13315 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ATMQ13315 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ATMQ13315 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ATMQ13315 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ATMQ13315 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ATMQ13315 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ATMQ13315 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ATMQ13315 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ATMQ13315 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
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