Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CSTF3Q12996 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms