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| PTP4A2 | Q12974 | AC008163.1-205 | ENST00000413944 | 4649 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AC130466.1-201 | ENST00000636354 | 4683 nt | TSL 5 BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AC073544.1-201 | ENST00000600110 | 1595 nt | BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | SNORD114-6-201 | ENST00000364393 | 72 nt | BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
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| PTP4A2 | Q12974 | AC092813.2-201 | ENST00000434540 | 399 nt | TSL 3 BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
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| PTP4A2 | Q12974 | 5S_rRNA.11-201 | ENST00000618635 | 84 nt | BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | Six3os1_7.1-201 | ENST00000621512 | 201 nt | BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AC008555.8-201 | ENST00000623602 | 2168 nt | BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | KPNA5-202 | ENST00000368564 | 11311 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | ZNF451-208 | ENST00000491832 | 3632 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | OSTN-201 | ENST00000339051 | 402 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | U8.2-201 | ENST00000363156 | 134 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | U3.8-201 | ENST00000363675 | 217 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
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| PTP4A2 | Q12974 | Y_RNA.415-201 | ENST00000384012 | 112 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | SNORA67.2-201 | ENST00000384300 | 149 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | RNA5SP425-201 | ENST00000410336 | 112 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | RNU6-1001P-201 | ENST00000411265 | 100 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | LINC01509-202 | ENST00000423523 | 408 nt | TSL 3 BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AL445646.1-201 | ENST00000431784 | 216 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AL121890.1-201 | ENST00000435457 | 205 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AC016717.1-201 | ENST00000448918 | 286 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | NDUFB4P10-201 | ENST00000452541 | 359 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | LINC01766-201 | ENST00000453968 | 362 nt | TSL 3 BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | RNU6-1170P-201 | ENST00000515974 | 106 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
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| PTP4A2 | Q12974 | RNU6-856P-201 | ENST00000516959 | 98 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | RNU6-699P-201 | ENST00000517081 | 110 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AC005786.1-201 | ENST00000588553 | 154 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AC002984.1-201 | ENST00000591692 | 448 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | AL357054.2-201 | ENST00000607644 | 423 nt | TSL 5 BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | Y_RNA.783-201 | ENST00000613546 | 102 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | MIR219B-201 | ENST00000637023 | 88 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | PYGO1-201 | ENST00000302000 | 8488 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| PTP4A2 | Q12974 | ZNF702P-202 | ENST00000434269 | 1966 nt | BASIC | 2.12 | □□□□□ -2.07 | | |