Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CHD3Q12873 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
CHD3Q12873 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CHD3Q12873 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CHD3Q12873 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CHD3Q12873 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CHD3Q12873 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CHD3Q12873 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CHD3Q12873 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CHD3Q12873 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CHD3Q12873 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CHD3Q12873 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
CHD3Q12873 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CHD3Q12873 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CHD3Q12873 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CHD3Q12873 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CHD3Q12873 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
CHD3Q12873 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
CHD3Q12873 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
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