Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCAPQ12770 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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