Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ERFP50548 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ERFP50548 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ERFP50548 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ERFP50548 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ERFP50548 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ERFP50548 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ERFP50548 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ERFP50548 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ERFP50548 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ERFP50548 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ERFP50548 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ERFP50548 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ERFP50548 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ERFP50548 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ERFP50548 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ERFP50548 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ERFP50548 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ERFP50548 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ERFP50548 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERFP50548 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERFP50548 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERFP50548 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERFP50548 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ERFP50548 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ERFP50548 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERFP50548 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ERFP50548 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERFP50548 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ERFP50548 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERFP50548 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERFP50548 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ERFP50548 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ERFP50548 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERFP50548 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ERFP50548 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERFP50548 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERFP50548 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERFP50548 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERFP50548 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERFP50548 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERFP50548 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERFP50548 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERFP50548 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERFP50548 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERFP50548 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERFP50548 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERFP50548 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERFP50548 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
ERFP50548 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
ERFP50548 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERFP50548 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERFP50548 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERFP50548 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
ERFP50548 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERFP50548 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ERFP50548 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERFP50548 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
ERFP50548 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
ERFP50548 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERFP50548 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERFP50548 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERFP50548 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERFP50548 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERFP50548 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERFP50548 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ERFP50548 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERFP50548 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERFP50548 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ERFP50548 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ERFP50548 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERFP50548 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERFP50548 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERFP50548 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERFP50548 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERFP50548 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERFP50548 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ERFP50548 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ERFP50548 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERFP50548 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERFP50548 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERFP50548 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERFP50548 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERFP50548 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERFP50548 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERFP50548 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ERFP50548 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
ERFP50548 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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