Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ISM1B1AKI9 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ISM1B1AKI9 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.8 ms