Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
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HOXD1Q9GZZ0 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
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HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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HOXD1Q9GZZ0 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HOXD1Q9GZZ0 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
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