Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC0.16□□□□□ -2.38
CCDC90BQ9GZT6 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CCDC90BQ9GZT6 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CCDC90BQ9GZT6 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CCDC90BQ9GZT6 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CCDC90BQ9GZT6 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CCDC90BQ9GZT6 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
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CCDC90BQ9GZT6 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
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CCDC90BQ9GZT6 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
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CCDC90BQ9GZT6 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
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CCDC90BQ9GZT6 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
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CCDC90BQ9GZT6 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
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CCDC90BQ9GZT6 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
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CCDC90BQ9GZT6 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
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CCDC90BQ9GZT6 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
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CCDC90BQ9GZT6 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
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CCDC90BQ9GZT6 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CCDC90BQ9GZT6 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
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