Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRERF1Q96PN7 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms