Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BCANQ96GW7 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
BCANQ96GW7 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
BCANQ96GW7 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BCANQ96GW7 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BCANQ96GW7 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BCANQ96GW7 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BCANQ96GW7 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BCANQ96GW7 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BCANQ96GW7 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BCANQ96GW7 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BCANQ96GW7 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
BCANQ96GW7 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BCANQ96GW7 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
BCANQ96GW7 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
BCANQ96GW7 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
BCANQ96GW7 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
BCANQ96GW7 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BCANQ96GW7 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms