Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MSMPQ1L6U9 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MSMPQ1L6U9 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
MSMPQ1L6U9 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
MSMPQ1L6U9 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
MSMPQ1L6U9 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
MSMPQ1L6U9 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
MSMPQ1L6U9 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
MSMPQ1L6U9 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
MSMPQ1L6U9 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
MSMPQ1L6U9 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
MSMPQ1L6U9 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
MSMPQ1L6U9 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
MSMPQ1L6U9 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
MSMPQ1L6U9 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
MSMPQ1L6U9 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
MSMPQ1L6U9 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
MSMPQ1L6U9 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
MSMPQ1L6U9 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
MSMPQ1L6U9 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
MSMPQ1L6U9 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
MSMPQ1L6U9 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
MSMPQ1L6U9 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
MSMPQ1L6U9 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
MSMPQ1L6U9 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
MSMPQ1L6U9 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
MSMPQ1L6U9 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
MSMPQ1L6U9 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
MSMPQ1L6U9 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
MSMPQ1L6U9 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
MSMPQ1L6U9 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MSMPQ1L6U9 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms