Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
RTL8BQ17RB0 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
RTL8BQ17RB0 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
RTL8BQ17RB0 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
RTL8BQ17RB0 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
RTL8BQ17RB0 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
RTL8BQ17RB0 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
RTL8BQ17RB0 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
RTL8BQ17RB0 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
RTL8BQ17RB0 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
RTL8BQ17RB0 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
RTL8BQ17RB0 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
RTL8BQ17RB0 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
RTL8BQ17RB0 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
RTL8BQ17RB0 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
RTL8BQ17RB0 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
RTL8BQ17RB0 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
RTL8BQ17RB0 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
RTL8BQ17RB0 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
RTL8BQ17RB0 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
RTL8BQ17RB0 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
RTL8BQ17RB0 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
RTL8BQ17RB0 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
RTL8BQ17RB0 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
RTL8BQ17RB0 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
RTL8BQ17RB0 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
RTL8BQ17RB0 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
RTL8BQ17RB0 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
RTL8BQ17RB0 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
RTL8BQ17RB0 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
RTL8BQ17RB0 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
RTL8BQ17RB0 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
RTL8BQ17RB0 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
RTL8BQ17RB0 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
RTL8BQ17RB0 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
RTL8BQ17RB0 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
RTL8BQ17RB0 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RTL8BQ17RB0 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RTL8BQ17RB0 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RTL8BQ17RB0 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RTL8BQ17RB0 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RTL8BQ17RB0 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RTL8BQ17RB0 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RTL8BQ17RB0 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RTL8BQ17RB0 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
RTL8BQ17RB0 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RTL8BQ17RB0 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RTL8BQ17RB0 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RTL8BQ17RB0 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RTL8BQ17RB0 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
RTL8BQ17RB0 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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RTL8BQ17RB0 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
RTL8BQ17RB0 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RTL8BQ17RB0 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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RTL8BQ17RB0 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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RTL8BQ17RB0 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RTL8BQ17RB0 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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RTL8BQ17RB0 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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RTL8BQ17RB0 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RTL8BQ17RB0 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RTL8BQ17RB0 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RTL8BQ17RB0 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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RTL8BQ17RB0 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
RTL8BQ17RB0 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RTL8BQ17RB0 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RTL8BQ17RB0 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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RTL8BQ17RB0 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RTL8BQ17RB0 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
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RTL8BQ17RB0 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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RTL8BQ17RB0 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
RTL8BQ17RB0 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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RTL8BQ17RB0 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
RTL8BQ17RB0 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RTL8BQ17RB0 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RTL8BQ17RB0 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RTL8BQ17RB0 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RTL8BQ17RB0 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RTL8BQ17RB0 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
RTL8BQ17RB0 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RTL8BQ17RB0 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RTL8BQ17RB0 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RTL8BQ17RB0 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RTL8BQ17RB0 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
RTL8BQ17RB0 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
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