Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

Predictions only

Length 1,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
PTPN21Q16825 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPN21Q16825 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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