| PTPN21 | Q16825 | RNU7-14P-201 | ENST00000459331 | 62 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SRP72-202 | ENST00000504757 | 745 nt | TSL 2 BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNA5SP148-201 | ENST00000516527 | 94 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AP003465.1-201 | ENST00000520575 | 382 nt | TSL 2 BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTPN21 | Q16825 | CPSF6-207 | ENST00000551516 | 234 nt | TSL 2 BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC022469.2-201 | ENST00000554759 | 396 nt | TSL 5 BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MZT1P2-201 | ENST00000604387 | 248 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTPN21 | Q16825 | BCL2L11-225 | ENST00000640419 | 249 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTPN21 | Q16825 | ANKRD18EP-201 | ENST00000405487 | 2632 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTPN21 | Q16825 | KTN1-203 | ENST00000395309 | 4021 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SNORA38-201 | ENST00000363946 | 132 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
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| PTPN21 | Q16825 | MIR300-201 | ENST00000401138 | 83 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
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| PTPN21 | Q16825 | IFNA11P-201 | ENST00000446352 | 526 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SRI-210 | ENST00000490437 | 570 nt | TSL 2 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6-1012P-201 | ENST00000516606 | 109 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
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| PTPN21 | Q16825 | RNU6-667P-201 | ENST00000517186 | 102 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC034114.1-201 | ENST00000520293 | 285 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | NDUFA5P6-201 | ENST00000542110 | 379 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RRN3P3-201 | ENST00000549207 | 578 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | CR936218.1-201 | ENST00000570454 | 304 nt | TSL 2 BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC008873.1-201 | ENST00000625051 | 138 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC068205.3-201 | ENST00000636385 | 468 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | U6.92-201 | ENST00000636464 | 89 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | IDE-201 | ENST00000265986 | 5877 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | TAB3-205 | ENST00000378933 | 6671 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | ATF1-201 | ENST00000262053 | 2181 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | ZCCHC10-202 | ENST00000355372 | 2160 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SYTL2-230 | ENST00000634661 | 6672 nt | TSL 5 BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | OR5V1-217 | ENST00000641768 | 2763 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | Y_RNA.145-201 | ENST00000363527 | 102 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SNORA67.2-201 | ENST00000384300 | 149 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | Y_RNA.527-201 | ENST00000384573 | 102 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | Y_RNA.551-201 | ENST00000384661 | 102 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AL033519.2-201 | ENST00000403958 | 392 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MRPL35P1-201 | ENST00000404272 | 572 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MIR1252-201 | ENST00000408861 | 65 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC110995.1-201 | ENST00000444185 | 628 nt | TSL 3 BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | PCNPP5-201 | ENST00000452246 | 481 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC108752.1-201 | ENST00000484679 | 576 nt | TSL 5 BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC010469.2-201 | ENST00000496412 | 480 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
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| PTPN21 | Q16825 | AC074133.1-201 | ENST00000515696 | 183 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | Y_RNA.715-201 | ENST00000517082 | 110 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | LINC02165-201 | ENST00000563061 | 443 nt | TSL 3 BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC022809.1-201 | ENST00000579247 | 428 nt | TSL 3 BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC010205.1-201 | ENST00000616668 | 449 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6-727P-201 | ENST00000363592 | 107 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MIR586-201 | ENST00000385035 | 97 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | HMGN2P18-201 | ENST00000450680 | 270 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AL590422.1-201 | ENST00000451829 | 364 nt | TSL 3 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | NDUFB4P10-201 | ENST00000452541 | 359 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SRIP1-201 | ENST00000489235 | 288 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RPS29P21-201 | ENST00000496272 | 170 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC096725.1-201 | ENST00000514266 | 313 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNA5SP490-201 | ENST00000517141 | 136 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC113195.1-201 | ENST00000579952 | 141 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MIR4658-201 | ENST00000584344 | 65 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AL360085.1-201 | ENST00000604713 | 532 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC091965.1-202 | ENST00000607662 | 397 nt | TSL 3 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | ETDC-201 | ENST00000635820 | 180 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | ZNF280D-204 | ENST00000558320 | 3666 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | OR4K2-204 | ENST00000641885 | 8681 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MACC1-202 | ENST00000400331 | 9159 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | WWP1-201 | ENST00000265428 | 3362 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | WDR3-201 | ENST00000349139 | 9974 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MARCH7-203 | ENST00000409591 | 2147 nt | TSL 2 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | FAM46D-201 | ENST00000308293 | 3011 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | ZMYM1-203 | ENST00000373330 | 4203 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | APCS-201 | ENST00000255040 | 926 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | RNU6-450P-201 | ENST00000364654 | 107 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MIR592-201 | ENST00000384959 | 97 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MIR1283-1-201 | ENST00000408494 | 87 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | UQCRBP2-201 | ENST00000447827 | 297 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC016925.1-201 | ENST00000458303 | 298 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | SNORA40.9-201 | ENST00000515895 | 93 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | Y_RNA.713-201 | ENST00000517013 | 96 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | IGKV3-31-201 | ENST00000523109 | 329 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | AC233702.2-202 | ENST00000562547 | 291 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTPN21 | Q16825 | MIR4659A-201 | ENST00000580269 | 81 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |